Quando Batgirl e Nightwing decidono che per Batman è giunta l'ora di una vacanza, il capo accetta con riluttanza di partire, incaricando Superman e la Justice League di sorvegliare la città di Gotham. Ma nessuna delle due situazioni sembra prendere la giusta piega: il Bat-trio incontra vecchi villains e la Justice League scopre quanto sia occupato regolarmente Batman. Una battaglia di mattoncini su due fronti: Batman, Batgirl e Nightwing prendono Bane e Deathstroke, mentre la Lega della giustizia - con un piccolo aiuto da parte di alcuni Titani - affronta un attacco da parte di alcuni tra i più acerrimi nemici di Batman per garantire la sicurezza di Gotham. Superman cade in una trappola, ma fortunatamente in suo soccorso arrivano Robin, Wonder Woman e Cyborg per sconfiggere il crimine mentre il capo è lontano.

Justice League - Fuga da Gotham City apre un nuovo capitolo per i celeberrimi personaggi, in cui tutto va per il verso storto con un passato estremamente pericoloso fatto d'invasioni dal centro della terra e nemici sempre più agguerriti.