Lindsay MacGowan ha iniziato la carriera a diciassette anni lavorando nel reparto trucco del film di Ridley Scott Legend. Il suo primo progetto con Stan Winston è stato Aliens che è stato anche l'inizio di un fortunato sodalizio con lo Stan Winston Studio nell'ambito del quale la MacGowan ha potuto sviluppare il suo talento creativo lavorando nel settore della progettazione e realizzazione degli stampi e dei calchi e in quello dei capelli e acconciature diventando poi con gli anni uno dei 4 supervisori dello studio.
Prima di trasferirsi definitivamente a Los Angeles dall'Inghilterra, la MacGowan aveva già collaborato alla realizzazione di numerosi film di grande successo tra cui ricordiamo Storyteller
di Jim Henson, The Witches; Intervista con il vampiro e il pluripremiato Babe-Un maialino coraggioso.
La MacGowan ha collaborato allo sviluppo di alcune delle tecniche e dei materiali chiave utilizzati dallo Stan Winston Studio per realizzare piume, capelli e protesi di silicone per pupazzi ed effetti trucco in film quali Instinct, Jurassic Park e Paulie-Il pappagallo che parlava troppo per il quale è stata anche supervisore agli effetti speciali.
La MacGowan e Alan Scott sono stati supervisori agli effetti speciali per A.I.: Intelligenza Artificiale candidato all'Oscar e ha collaborato alla realizzazione degli effetti speciali di Big Fish diretto da Tim Burton. Inoltre, è stata supervisore agli effetti speciali per conto dello Stan Winston Studio per La guerra dei mondi di Steven Spielberg ed è stata la coordinatrice degli effetti, sempre per conto dello studio, per La tela di Carlotta con la supervisione di Alan Scott.