Wes Ball è cresciuto a Lake Como, in Florida, e ha frequentato la Florida State University, dove ha conseguito la laurea in cinema. Ball ha catturato per la prima volta l'attenzione grazie al suo cortometraggio studentesco, A Work in Progress, che è stato premiato con uno Student Academy Award.
Nel 2012 Ball ha creato, prodotto e diretto il cortometraggio originale in 3D Ruin. Ball ha postato il cortometraggio online: è diventato virale, ottenendo il plauso della critica e totalizzando più di 27 milioni di visualizzazioni fino a oggi. Quella stessa settimana, lo studio lo ha contattato per proporgli di dirigere il suo primo film, Maze Runner - Il labirinto. Prodotto con un budget di 34 milioni di dollari, Maze Runner - Il labirinto ha incassato più di 350 milioni di dollari in tutto il mondo, dando inizio a un franchise. Ball ha quindi diretto il resto della trilogia, che comprende Maze Runner - La fuga e Maze Runner - La rivelazione. Anche questi ultimi due film hanno riscosso un grande successo in tutto il mondo e finora il franchise ha incassato quasi 1 miliardo di dollari al botteghino.
Nel 2024 dirige Il regno del pianeta delle scimmie.