Per Nicola il debutto al cinema avviene nel 2006 con un piccolo ruolo nel film Il mio miglior nemico di Carlo Verdone, cui segue Viva Franconi di Luca Verdone, in cui è co-protagonista nel ruolo di Hanry. Nello stesso anno interpreta il ruolo di Igor nella serie tv Orgoglio, capitolo terzo. Nel 2007 partecipa alla miniserie tv Donne sbagliate, regia di Monica Vullo, con Virna Lisi, Manuela Arcuri e Nancy Brilli, e Il Giudice Mastrangelo 2, per la regia di Enrico Oldoini, con Diego Abatantuono e Alessia Marcuzzi. Nello stesso anno è protagonista del cortometraggio Attimi di fuga, regia di Umberto Innocenzi, al fianco di Giancarlo Giannini e partecipa alle pellicole Decameron Pie, Maradona - La mano de Dios di Marco Risi e Milano Palermo - Il ritorno di Claudio Fragasso. Nicola Canonico torna ad essere diretto da Claudio Fragasso nella pellicola Le ultime 56 ore, un mix tra un film d'amore, d'azione e un giallo. Nicola è Lepore, il capo dei Nox, un uomo diviso tra l'impegno professionale, che lo vuole freddo e fermo nelle decisioni, e la sua coscienza di uomo.
Nicola nel 2010 è impegnato anche in teatro con la tournèe dello spettacolo "Un minuto di silenzio" insieme a Christian Marazziti e Angelo Orlando.